يوجد العديد من التغييرات في عدد وحجم وتنظيم الكروموسومات داخل الطفرات الصبغية او التشوهات الكروموسومية او الانحرافات الصبغية وتشمل أنواع الطفرات الكروموسية مايلي:
هذا النوع من الطفرة يحدث فيه تكسر لقطعه من الكروموسوم لكي تلتصق بكروموسوم آخر ويوصف هذا النوع من الطفرة بأنه نوع متوازن حيث لا يحدث به اكتساب ولا يحدث به فقدان لأي مادة وراثية داخل الخلية.
عمليات الحذف هي عبارة عن كسر الكروموسوم مما يسبب فقدان بعض من مواده الجينية ومن الممكن أن تكون الجزء المفقود كبير ومن الممكن أن يكون جزء صغير وتتم عملية الحذف في أي مكان في الكروموسوم.
يحدث في هذا النوع المضاعات التي تحدث بعد إتمام عملية نسخ جزء من الكروموسومات لعدة مرات مما يسبب إنتاج نسخ إضافية من المادة الوراثية بسبب التغيير الكروموسومي
يحدث داخل هذا النوع من الطفليات كسر في الكروموسوم في مكانين مختلفين داخل الكروموسوم مما يسبب في عكس الجزء الناتج من الحمض النووي